GOOGLE ADS

суббота, 30 апреля 2022 г.

Установка пакета R из GitHub - "'' не существует в текущем рабочем каталоге

Я создал новый пакет, и он размещен на GitHub по адресу github.com/kevinwolz/hisafer.

Я пытаюсь установить пакет через devtools::install_github(), но получаю странную ошибку. Помощь?

>install_github("kevinwolz/hisafer")
Downloading GitHub repo kevinwolz/hisafer@master
from URL https://api.github.com/repos/kevinwolz/hisafer/zipball/master
Installing hisafer

[Здесь 5 зависимостей пакетов (dplyr, tidyr, purrr, ggplot2, lubridate) автоматически успешно установлены, но я не убрал текст]

"C:/Users/wolzkevi/DOCUME~1/R/R-34~1.3/bin/x64/R" --no-site-file --no-environ --no-save \
--no-restore --quiet CMD INSTALL \
"C:/Users/wolzkevi/AppData/Local/Temp/Rtmpg5OyD6/devtools28843ed4c0a/kevinwolz-hisafer-bf69883" \
--library="C:/Users/wolzkevi/Documents/R/R-3.4.3/library" --install-tests
* installing *source* package 'hisafer'...
** R
** inst
** preparing package for lazy loading
Error: '' does not exist in current working directory ('C:/Users/wolzkevi/AppData/Local/Temp/Rtmpg5OyD6/devtools28843ed4c0a/kevinwolz-hisafer-bf69883').
Error: unable to load R code in package 'hisafer'
ERROR: lazy loading failed for package 'hisafer'
* removing 'C:/Users/wolzkevi/Documents/R/R-3.4.3/library/hisafer'
In R CMD INSTALL
Installation failed: Command failed (1)

Кажется, что критическая ошибка здесь «Ошибка: '' не существует в текущем рабочем каталоге». Кто-нибудь знает, почему это может происходить? Есть ли что-то в способе создания/установки моего пакета, что вызывает проблемы? Я могу установить пакет из исходного кода без проблем, загружая его с GitHub, так что это наводит меня на мысль, что в процессе GitHub происходит что-то странное.

ИНФОРМАЦИЯ О СЕССИИ:

R version 3.4.3 (2017-11-30)
Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
Matrix products: default
locale:
[1] LC_COLLATE=French_France.1252 LC_CTYPE=French_France.1252
[3] LC_MONETARY=French_France.1252 LC_NUMERIC=C
[5] LC_TIME=French_France.1252
attached base packages:
[1] stats graphics grDevices utils datasets methods base
other attached packages:
[1] devtools_1.13.4
loaded via a namespace (and not attached):
[1] httr_1.3.1 compiler_3.4.3 R6_2.2.2 tools_3.4.3 withr_2.1.1 curl_3.1
[7] memoise_1.1.0 knitr_1.19 git2r_0.21.0 digest_0.6.15


Решение проблемы

Проблема в том, что в R/utils.R, вы пытаетесь прочитать файлы из inst/extdataкоторых не существует (это из строк 36 и 37):

INPUT.DEFS <- readr::read_delim(system.file("extdata", "input_defs.txt", package = "hisafer"), "\t", col_types = readr::cols())
OUTPUT.DEFS <- dplyr::arrange(readr::read_delim(system.file("extdata", "output_defs.txt", package = "hisafer"), "\t", col_types = readr::cols()), profile, name)

Осмотр inst/extdataпокажет вам ни того, input_defs.txtни другого output_defs.txt.

Как я это понял?

я побежал

devtools::load_all("hisafer/")

что тоже выдает ошибку

Ошибка: '' не существует в текущем рабочем каталоге

но позволяет показать информативную трассировку:

13.stop("'", path, "' does not exist", if (!is_absolute_path(path)) paste0(" in current working directory ('", 
getwd(), "')"), ".", call. = FALSE)
12.check_path(path)
11.standardise_path(file)
10.read_delimited(file, tokenizer, col_names = col_names, col_types = col_types,
locale = locale, skip = skip, comment = comment, n_max = n_max,
guess_max = guess_max, progress = progress)
9.readr::read_delim(system.file("extdata", "input_defs.txt", package = "hisafer"),
"\t", col_types = readr::cols()) at utils.R#36
8.eval(exprs[i], envir)
7.eval(exprs[i], envir)
6.source_one(file, envir = envir)
5.source_many(paths, env)
4.force(code)
3.withr_with_dir(file.path(pkg$path), source_many(paths, env))
2.load_code(pkg)
1.devtools::load_all("hisafer/")

Обратите внимание на номер 9 в трассировке, которая не только отображала проблемный код, но также услужливо показывала, из какого файла он был взят и на какой строке он находился.

Источник проблемы: Ваш.gitignore

В вашем .gitignoreу вас есть строки

inst/extdata/
inst/extdata/*

это означает, что все файлы и подпапки inst/extdata/не отслеживаются, поэтому, когда пользователи пытаются установить с GitHub, они не получают extdata/файлы, необходимые для правильной работы вашего пакета.

В качестве примечания, даже если пользователь загрузит ваш репозиторий и вручную добавит input_defs.txtи output_defs.txt, у него не будет других каталогов шаблонов, которые вы хотите, чтобы они имели по той же причине, поэтому создание виньеток вызывает ошибку при установке.

Комментариев нет:

Отправить комментарий

Laravel Datatable addColumn returns ID of one record only

Я пытаюсь использовать Yajra Datatable для интеграции DataTable на свой веб-сайт. Я смог отобразить таблицу, но столкнулся с проблемой. В по...